相关动态
GaussView基础教程
2024-12-05 22:01
GaussView基础教程 基础教程 GaussView基础教程

GaussView教程【1】——界面介绍

Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。

菜单栏

▪【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件

▪【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等

▪【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等

▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算

▪【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果

▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等

▪【Help】帮助

快速工具栏

【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。

【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;

【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等

【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸

【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处

这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】

这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

3、常用工具栏

这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子

这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。

1、开启Gview

2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环

在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯环。

单击左键,可以将主程序框体中的分子或基团加入到工作窗口;

按上下左右键,或者左键单击不放移动鼠标,可以调节分子的角度;

滚动鼠标滚轮,可以放大缩小分子;

按住shift键,左键单击不放移动鼠标,可以移动分子;

当工作窗口内有多个分子时(在构建大的分子时,这种情况很容易出现)

用Shift+Alt+鼠标左键组合,移动想要移动的分子;

用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调节其中一个分子的角度;

双击图标(或者左键不放),在元素周期表中选择【F】元素,回到工作窗口在苯的任意一个【H】上单击,使之变成【F】

双击图标,从链烃库中选择【乙基】(第一个),然后点击间位上的【H】即可

至此,分子式已经构建完成,Gview存储个人常用分子的功能,双击view上的

图标,在下面的对话框中键入相关项目,保存即可。

(注:我的程序此项功能不行,用户自定义基团)

查看分子坐标:单击Gview界面的图标,查看分子的坐标。

至此,我们保存一下我们构建好的间氟苯乙烷分子,在绘图界面右键单击【File】——【Save】然后选择保存路径即可。

GaussView教程【3】——向Gaussian提交计算

上一讲我们已经构建好了一个间氟苯乙烷分子,现在打开间氟苯乙烷分子。

点击Gview界面上的【Calculate】——【GaussianCalculateSetup】

从对话框中我们可以选择许多参数,下面依次选择一下

【JobType】工作类型:

【Energy能量】|【Optimization优化】|【Frequency频率】|【Opt+Freq 优化+频率】|【Scan扫描】|【Stability稳定性】|【NMR核磁】,

这里我们选择【NMR】核磁

【Method】方法:每种计算模式都提供了若干种方法,这里选择默认值即可【Title】题目:这项可以根据自己的项目自行命名

【link0】给检查点文件命名

其它选择默认即可

选好后点击【Submit】提交至Gaussian,并保存。(最好存到安装文件所在磁盘)

系统会询问是否提交至Gaussian,选择【OK】,Gaussian会自动开启并计算,计算时间因硬件配置而异

计算完毕后系统会提示关闭Gaussian,点击【是】

计算完毕后会生成两个文件,.log的是系统日志,便于查看计算结果。这里我们选择.chk文件【Ok】

接下来我们又一次看到了刚才绘制的那个分子,表面上没什么不同,但这次我们可以预言它的许多性质了,在GView的主界面点击【Results】——【Summary】可以看到刚才的计算总结,点击【ViewFile】可以看到日志文件。

因为我们刚才选择计算模式是【NMR】核磁,所以我们点击【Results】——【NMR】,随即我们看到了很熟悉的核磁图谱,但似乎很乱,因为这是所有元素的核磁谱图,在左下方【Element】右方选择【H】,即H谱,旁边【Reference】选择

【TMSHF/6-31G(d)】,这次我们就可以看到间氟苯乙烷分子理论计算的核磁谱图了。

    以上就是本篇文章【GaussView基础教程】的全部内容了,欢迎阅览 ! 文章地址:http://sjzytwl.xhstdz.com/news/10205.html 
     栏目首页      相关文章      动态      同类文章      热门文章      网站地图      返回首页 物流园资讯移动站 http://sjzytwl.xhstdz.com/mobile/ , 查看更多   
最新文章
皑雪燃烽燧——iGame GeForce RTX 5090 D Vulcan W OC 32GB:定义显卡旗舰最强形态
关于iGame Vulcan系列,相信大家对它的印象总是停留在极具质感以及充满赛博气息的外观设计上,并惯常以灰、黑、金等颜色用以装点
古装剧的春天来了!《凡人修仙传》首播将至,杨洋帅出新高度
陈都灵,辛云来主演的《雁回时》还在热播中,唐嫣,刘学义主演的《念无双》就上线了。都是热门的题材类型,看剧情和人设也都很有
美菲军事动作不断,菲引入外部势力是冒险
3月28日,美国国防部长赫格塞思在马尼拉举行的新闻发布会上宣称,美国将与菲律宾携手在印太地区重建军事威慑,重申所谓“共同防
金地集团熬过来了吗?
金地集团在2024年迎来了偿债高峰,共有9笔境内债、1笔境外债、3笔ABS到期,根据年报披露,金地集团已按时足额偿付共约200亿元的
Amazon 推出 AI 智能购物助手,洞悉你的喜好
Amazon 最新成为加入生成式 AI 工具阵营的科技公司,推出旨在个性化在线购物体验的新功能。周三,Amazon 在一篇博文中宣布推出名
“2025三星家电新品发布会”举行:全系家电焕新登场,构建AI家居新范式
三星家电日前举行2025年新品发布会,焕新推出2025 Neo QLED 8K/4K、OLED与新款The Frame画壁艺术电视,以及AI神系列生活家电、显
上海启动人工智能创业营!科创板人工智能ETF现涨超2%,实时成交额快速突破5000万元
消息面上,本周举行的2025上海全球投资促进大会的系列活动——“科技创新 引领未来”创业投资论坛启动人工智能创业营。当日论坛
再见杭州
此时此刻,我在杭州家里打包行李,叫跨城搬家公司,把它们搬回上海。离开这座生活、工作了十五年的城市,我心情复杂。三月,孤山
曝佩顿二世左手拇指韧带撕裂,将无限期休战!勇士冲季后赛悬了
北京时间3月28日,名记Shams爆料——勇士球员加里·佩顿二世左手拇指韧带撕裂,归期未定。根据此前勇士队记Anthony Slater报道,
苏州工业园区“以数治税”便企惠企
当前,国家税务总局苏州工业园区税务局(以下简称“园区税务局”)紧跟数字化发展趋势,将海量的涉税数据资源作为核心竞争力和新